刘太岗——副教授
个人基本情况：
刘太岗，男，1982年生，山东泰安人。现为上海海洋大学beat365官方最新版副教授，硕士生导师。研究方向：机器学习、生物信息学、数学建模等。
已发表SCI论文20余篇；主持国家自然科学基金青年项目1项，上海市教委创新项目1项，上海高校青年教师培养资助计划1项，校博士启动基金1项，参与国家自然科学基金面上项目2项；入选2018年上海高水平地方高校战略创新团队。
主要研究方向：
（1）机器学习基础理论算法及其在生物医学大数据建模中的应用；
（2）水产动物基因组数据挖掘及数据库整合开发（与生命学院陈良标教授团队联合培养）；
（3）生物信息学分析。
主持科研项目：
(1) 国家自然科学基金青年项目，11601324，基于多源信息融合的蛋白酶裂解位点预测算法研究，2016/01-2019/12，结题，主持。
(2) 上海市教委创新项目，13YZ098，蛋白酶裂解位点预测的生物信息学方法研究，2013/01-2015/12，结题，主持。
(3) 上海高校青年教师培养资助计划，ZZhy12028，基于信息融合的蛋白质相互作用预测方法研究，2013/01-2014/12，结题，主持。
(4) 国家自然科学基金面上项目，41376135，洋山深水港病毒生物多样性的宏基因组学研究，2014/01 - 2017/12，结题，主要参与人。
(5) 国家自然科学基金面上项目，31570112，藻类巨病毒噬病毒体(Virophage)的发现与鉴定，2016/01 - 2019/12，结题，主要参与人。
发表学术论文：
[1] Ding C, Han H, Li, Q, Yang X, and Liu T*, iT3SE-PX: Identification of Bacterial Type III Secreted Effectors Using PSSM Profiles and XGBoost Feature Selection, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2021, doi: 10.1155/2021/6690299. (SCI, 第一作者为2019级研究生)
[2] Yang Y, Zheng H, Wang C, Xiao W, Liu T*, Predicting Apoptosis Protein Subcellular Locations based on the Protein Overlapping Property Matrix and Tri-Gram Encoding, Int J Mol Sci, 2019, 20(9), doi: 10.3390/ijms20092344. (SCI, 第一作者为2015级本科生，保送南京大学)
[3] Xiuzhi Sang, Wanyue Xiao, Huiwen Zheng, Yang Yang, and Taigang Liu*, HMMPred: Accurate Prediction of DNA-Binding Proteins Based on HMM Profiles and XGBoost Feature Selection, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2020, doi: 10.1155/2020/1384749. (SCI, 第一作者为2018级研究生)
[4] Jun Wang, Huiwen Zheng, Yang Yang, Wanyue Xiao, and Taigang Liu*, PredDBP-Stack: Prediction of DNA-Binding Proteins from HMM Profiles using a Stacked Ensemble Method, BioMed Research International, 2020, doi: 10.1155/2020/7297631. (SCI，第一作者为2017级本科生，保送浙江大学)
[5] Peiying Tao, Taigang Liu*, Xiaowei Li, Lanming Chen*, Prediction of protein structural class using tri-gram probabilities of position-specific scoring matrix and recursive feature elimination, Amino Acids, 2015, 47: 461-468. (SCI，第一作者为联合培养食品学院研究生)
[6] Xiaowei Li, Taigang Liu*, Peiying Tao, Chunhua Wang, Lanming Chen*, A highly accurate protein structural class prediction approach using auto cross covariance transformation and recursive feature elimination, Computational Biology and Chemistry, 2015, 59: 95-100. (SCI，第一作者为联合培养食品学院研究生)
[7] Taigang Liu, Yufang Qin, Yongjie Wang*, Chunhua Wang*, Prediction of protein structural class based on gapped-dipeptides and a recursive feature selection approach, International Journal of Molecular Sciences, 2016, 17: 1. （SCI）
[8] Taigang Liu, Peiying Tao, Xiaowei Li, Yufang Qin, Chunhua Wang*, Prediction of subcellular location of apoptosis proteins combining tri-gram encoding based on PSSM and recursive feature elimination, Journal of Theoretical Biology, 2015, 366: 8-12. （SCI）
[9] Taigang Liu, Xingbo Geng, Xiaoqi Zheng*, Rensuo Li, Jun Wang, Accurate prediction of protein structural class using auto covariance transformation of psi-blast profiles, Amino Acids, 2012, 42: 2243-2249. （SCI）
[10] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng, Jun Wang*, Prediction of protein structural class using a complexity-based distance measure, Amino Acids, 2010, 38: 721-728. （SCI）
[11] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng*, Jun Wang, Prediction of protein structural class for low-similarity sequences using support vector machine and psi-blast profile, Biochimie, 2010, 92: 1330-1334. （SCI）
[12] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng*, Chunhua Wang, Jun Wang, Prediction of subcellular location of apoptosis proteins using pseudo amino acid composition: An approach from auto covariance transformation, Protein and Peptide Letters, 2010, 17: 1263-1269. （SCI）
获奖情况：
2012年，参加校青年教师讲课比赛获理工组一等奖； （校级）
2012年，上海大学生创新活动计划项目立项，任指导教师； （市级）
2012年，获上海高校青年教师培养资助计划项目资助； （市级）
2013年，获beat365官方最新版教学先进个人奖； （院级）
2013年，获上海市教委科研创新项目资助； （市级）
2013年，“首届滴水湖大学生创新活动论坛”获案例交流二等奖，任指导教师； （市级）
2014年，被评为“受学生欢迎的好老师”； （校级）
2014年，校人事考核优秀； （校级）
2015年，被评为“受学生欢迎的好老师”； （校级）
2015年，指导全国大学生数学建模竞赛获上海市一等奖； （市级）
2016年，被评为“受学生欢迎的好老师”； （校级）
2016年，《高等数学A》被评为“好课堂”； （校级）
2016年，入选三海人才“海燕计划”； （校级）
2016年，指导全国大学生数学建模竞赛获上海市三等奖； （国家级）
2016年，指导全国大学生数学竞赛获全国二等奖2人次； （国家级）
2016年，上海海洋大学科学成果奖三等奖，排名第三； （校级）
2016年，获国家自然科学基金青年基金项目资助； （国家级）
2017年，指导美国大学生数学建模竞赛获国际二等奖； （国际级）
2017年，指导全国大学生数学建模竞赛获上海市二等奖1项； （国家级）
2017年，指导全国大学生数学竞赛获全国一等奖1项； （国家级）
2017年，被评为“受学生欢迎的好老师”； （校级）
2018年，指导美国大学生数学建模竞赛获国际二等奖； （国际级）
2018年，被评为beat365官方最新版“优秀课程导师（班主任）”； （院级）
2018年，被评为“受学生欢迎的好老师”； （校级）
2018年，获“育才奖”；（校级）
2019年，指导全国研究生数学建模竞赛获全国二等奖一项；（国家级）
2019年，获评数学建模优秀教学团队（负责人）；（校级）
2020年，被评为“受学生欢迎的好老师”； （校级）
2020年，获教学名师荣誉称号；（校级）
2020年，指导全国研究生数学建模竞赛获全国二等奖1项，三等奖2项。（国家级）
教学工作：
《高等数学》、《线性代数》、《概率论与数理统计》、《数学实验与建模》
联系方式：
E-mail：tgliu@shou.edu.cn
个人主页：https://taigangliu.github.io/
联系地址：上海市浦东新区沪城环路999号，上海海洋大学beat365官方最新版401室
邮编：201306
